Das Management Team, der Vorstand, ist dafür verantwortlich, die Grundsätze und Leitlinien, die die Vollversammlung beschlossen hat, in die Praxis umzusetzen. Dies geschieht in Programmen und Projekten, die entweder in den Mitgliedskirchen regional oder international stattfinden, oder im Personalaustausch.
Der Generalsekretär, Pfarrer Dr. Andar Parlindungan, ist Vorsitzender des Vorstandes. Es gibt satzungsgemäß zwei Stellvertreter, Pfarrer Dr. John Wesley Kabango und Timo Pauler.
Der Vorstand führt und koordiniert das operative Geschäft der VEM, dass sich in 5 Divisionen aufteilt:
Afrika / Deutschland unter Leitung von Pfarrer Dr. John Wesley Kabango
Asien / Deutschland unter Leitung von Pfarrerin Dr. Dyah Krismawati
Ihnen zugeordnet sind die Regionalbüros in Dar es Salaam (Tansania), Pematangsiantar (Indonesien) sowie die Abteilung Deutschland, die Service Teams Projekte und Partnerschaften, die Freiwilligenprogramme, das Netzwerke für Junge Erwachsene, der Regionale Dienst und die jeweils in den Regionen eingesetzten Austauschmitarbeitenden.
Global Programs I unter Leitung von Pfarrerin Félicité Ngnintedem
Hier befinden sich die Abteilungen Evangelisation, Training & Empowerment, das Stipendienprogramm sowie die Abteilung Global Education.
Global Programs II
beinhaltet die Abteilungen JPIC (Justice, Peace und Integrety of Creation) mit Mitarbeitenden in Deutschland, Afrika und Asien, sowie Internationale Diakonie
Finanzen & Administration unter Leitung von Timo Pauler
Die Division umfasst die Abteilungen IT & Services, Communication & Fundraising, Human Resources sowie die Finanzbuchhaltung, Haus & Grund und die Hauswirtschaft.
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